Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VWA8A3KMH1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms