Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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