Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms