Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POMPQ9Y244 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms