Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
L1RE1Q9UN81 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms