Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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