Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIMS3Q9UJD0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms