Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIMD1Q9UGP4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIMD1Q9UGP4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms