Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms