Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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COPS7AQ9UBW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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COPS7AQ9UBW8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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COPS7AQ9UBW8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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COPS7AQ9UBW8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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COPS7AQ9UBW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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COPS7AQ9UBW8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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