Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DKK2Q9UBU2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms