Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RNF7Q9UBF6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RNF7Q9UBF6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RNF7Q9UBF6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RNF7Q9UBF6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RNF7Q9UBF6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RNF7Q9UBF6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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