Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TREX1Q9NSU2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms