Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C19orf12Q9NSK7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms