Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFGAP3Q9NP61 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFGAP3Q9NP61 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms