Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms