Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC6A16Q9GZN6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms