Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms