Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHACTR1Q9C0D0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHACTR1Q9C0D0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms