Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIFKQ9BYG3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms