Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOPXQ9BPY8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms