Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms