Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PCNX1Q96RV3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms