Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms