Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PGBD4Q96DM1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGBD4Q96DM1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGBD4Q96DM1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGBD4Q96DM1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGBD4Q96DM1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGBD4Q96DM1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGBD4Q96DM1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms