Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUB2Q96DC9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUB2Q96DC9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms