Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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USP9XQ93008 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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USP9XQ93008 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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USP9XQ93008 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
USP9XQ93008 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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