Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms