Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms