Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL3Q8N8U3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms