Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C8

LILRA3, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA3Q8N6C8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LILRA3Q8N6C8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms