Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD35Q8N283 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms