Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUFY3Q7L099 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms