Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP34Q70CQ2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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