Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIGD1Q6UXZ0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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