Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms