Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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