Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms