Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGL3Q3MIN7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms