Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms