Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNPY1Q3B7I2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CNPY1Q3B7I2 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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