Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL38Q2WGJ6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms