Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms