Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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