Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PTPRNQ16849 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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