Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKN3Q16667 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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