Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC18A3Q16572 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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