Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms