Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA6Q15825 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA6Q15825 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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