Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ALX1Q15699 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ALX1Q15699 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ALX1Q15699 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ALX1Q15699 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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ALX1Q15699 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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